１８世紀の初頭、シャイバニ朝の支配下にあったフェルガナ地方のコーカンド（ホーカンドともいう。現地では現在はコカンと発音している）を中心に、ウズベク人のミン氏族出身のシャー＝ルフがコーカンド＝ハン国を建設し、１８７６年まで存続した。この結果、１８世紀の西トルキスタンにはブハラ＝ハン国・ヒヴァ＝ハン国、コーカンド＝ハン国の三ハン国が存在し、領地をめぐって激しく争い、さらに北方からはカザフ人、キルギス、オイラートなどが、南方からはイラン人の侵出を受けて不安定な情勢が続いた。

ロシアへの併合

　クリミア戦争に敗北したロシアは、南下政策の鉾先を転じて、中央アジア進出を開始し、トルキスタン征服に乗り出した。１８６４年にコーカンド＝ハン国に対する攻撃を開始し、その結果、コーカンド＝ハン国は１８６７年についに滅亡し、肥沃なフェルガナ盆地はロシアの領有に帰した。同年、ロシアはタシケントに総督府を置いて植民地支配を開始した。