イラン高原に定着したイラン系民族メディア人が前８世紀に建国したメディア王国の都がエクバタナで、アッシリア帝国の支配を受けた後、メディア王国が独立を回復した４国分立時代においても都であった。現在のイラン西部の都市ハマダーンの古名。メディア王国のディオケス王が築いた城郭をもとに、イランからイラクへの交通路の拠点として栄えた。　→　位置は４国分立時代を参照
　ギリシアの歴史家ヘロドトスはその著『歴史』の中で、次のようにエクバタナの様子を伝えている。

Episode　多彩な環状城壁をもつ都市

（引用）ディオケスはこうして主権を掌握すると、メディア人に否やをいわせず単一の町を造らせ、それからは他の部落のことは二の次にして、専らこの町のことに専念するようにさせた。メディア人は彼のこの要求も容れたので、ディオケスは壮大強固な城郭を築いたが、これが今日アグバタナ（エクバタナ）の名で呼ばれる城で、同心円を描いて城壁が幾重にも重なり合っている。・・・環状の城壁は全部で七重になっており、・・・第一の城壁の輪の胸壁は白、第二は黒、第三は深紅色、第四は紺青、第五は橙赤色、・・・そして最後の二つの城壁は、その胸壁に一方は銀、他方は金の板をかぶせてある。＜ヘロドトス『歴史』巻一　９８節　松平千秋訳　岩波文庫（上）　p.82＞

アケメネス朝・ササン朝の夏の都に

　メディア王国が滅亡して前５５０年にイラン高原に成立したアケメネス朝ペルシア帝国は、エクバタナを都の一つ、夏の都とした。なおペルシア帝国では、冬の都はバビロンとされ、王宮が季節によって移動、さらに行政上はスサが、宗教ではペルセポリスが首都機能を有していた。
　前４世紀にはアレクサンドロス大王も東方遠征に際して占領した。ヘレニズム時代を経て３世紀に成立したササン朝ペルシアは前代のパルティアに続き、クテシフォンを都としたが、エクバタナは夏の都として利用された。

イスラーム時代のエクバタナ

　イスラーム時代には一つの地方都市にすぎなくなったが、１０３７年、イスラーム世界の偉大な医学者イブン＝シーナがこの地で亡くなり、いまでもその墓塔が町の中央に建っているという。
イランの首都の変遷　その後、イランを支配したイル＝ハン国はタブリーズを都とし、サファヴィー朝のアッバース１世は新都イスファハーンを建設した。１８世紀後半にイランを支配したトルコ系のカージャール朝、アーガー＝ムハンマドはイスファハーンとともに古都エクバタナも破壊し、テヘランを新たに建設し、現在もイランの首都とされている。