双方の独立した１９４７年以降、インドとパキスタンは３次にわたる戦争を展開した。第１次と第２次はカシミール帰属問題、第３次は東パキスタン独立問題をめぐって起こった。
第１次インド＝パキスタン戦争　１９４７年　独立に際し、カシミール藩王国の藩王はヒンドゥー教徒であったのでインド帰属をめざしたが、住民の大部分を占めるイスラーム教徒が反発し、１９４７年１０月２日にインド軍、パキスタン軍がそれぞれ軍を派遣し軍事衝突となった。インド軍優勢のうちに国際連合の調停で休戦した。
第２次インド＝パキスタン戦争　１９６５年　インドが実効支配していたジャンム＝カシミールの完全統合を宣言したことにパキスタンが反発。背景にはインドが中印国境紛争（１９６２年）で中国軍と戦い、実質的に敗北したことがあげられる。１９６５年９月６日にカシミール地方の国境上で両国が武力衝突し、米ソの国連での働きかけによって停戦が成立した。この停戦ラインによってそれぞれ実効支配を分けているが、双方ともカシミール全域の領有権の主張を取り下げておらず、国境問題は未解決となっている。
第３次インド＝パキスタン戦争　１９７１年　１２月３日、パキスタンが東部パキスタン（ベンガル地方）の独立運動を弾圧。多数の難民が発生した。インドのインディラ＝ガンディー政権は東部パキスタンに対して軍事援助を行って、独立を支援。インドが有利な闘いを進めて勝利し、その結果、東部パキスタンは独立してバングラデシュとなった。
　東パキスタンがパキスタンから分離した結果、インドとパキスタンの係争地点はカシミール問題に集中することとなり、両国はそれぞれの実効支配地域への軍配備を増強し、にらみ合いは続いている。
★印パキ戦争の年代をまとめて覚える　

　インドとパキスタンの皆さん、戦争にイクヨナ（１９４７）んて、ムゴ（６５）いことじゃナイ（７１）ですか？

印パの核実験

　特に８０年代には、インドにおけるヒンドゥー至上主義が台頭し、ナショナリズムを掲げたインド人民党（ＢＪＰ）が１９９８年には政権を獲得するに至り、パキスタンでも軍事政権によるイスラーム化が進められた。１９９８年にインドが核実験に踏み切ると、同年、パキスタンが核実験で対抗、南アジアにおける核戦争の勃発が危惧された。

印パ対立の背景の変化

　カシミール地方では、再三、両国軍が衝突する事態となったが、一定の抑止力が働き全面戦争へのエスカレートは抑制された。その背景には、１９９１年にソ連の解体し、東西冷戦の構造が解消されたことが挙げられる。それまでの両国の対立は、インドはソ連と、パキスタンはアメリカ及び中国と結びついてそれぞれ支援を受けるという構造があったが、ソ連の崩壊によってインドはアメリカとの和解に向かわざるを得なくなった。また、中国との関係も、中国で改革開放路線が進んだ結果として改善されていった。そのような中、両国とも核武装を維持することは経済を圧迫し、経済成長を阻害することが明らかになっていた。そのような中で２００１年、９.１１同時多発テロが発生、アメリカはイスラーム原理主義との対決を強めるため、インドとパキスタンの対立を解消する必要に迫られた。そのような情勢の変化から、アメリカはインド＝パキスタンの和平に積極的に関わり、両国関係は次第に安定した。
ムンバイ同時多発テロ　しかし、２００８年１１月にはインドのムンバイで同時多発テロが起こり、ホテルなどが襲撃され、日本人を含む１６０人が殺害された。インド当局は、パキスタンから越境したイスラーム過激派の犯行と断定し、パキスタン側に犯人の引き渡しを要求した。パキスタンはテロ実行犯を逮捕したが、インドへの引き渡しは拒否し、２０１５年４月の裁判では武装組織の司令官を証拠不十分として釈放した。インドは強く反発し、両国関係の悪化が危惧されている。